科学家李默在一次实验中意外获得隐形能力，却因无法承受孤独与力量而堕落，利用隐身术实施窃取与破坏。与此同时，同样源于实验事故的清洁工王强突变为蝇人，拥有超强感官与飞行能力。蝇男凭借对振动的敏锐察觉与高速飞行，追踪透明人的踪迹。两人在城市中展开追逐，透明人利用环境制造混乱，蝇男则以生物雷达破解隐形。最终，蝇男通过预判透明人的呼吸节奏成功将其制服，迫使他接受治疗。电影探讨了力量与责任的关系，以及异化与救赎的主题。