海洋学家杰克在深海考察时意外感染一种神秘病毒，身体逐渐变异，既能呼吸空气也能在水中自由游动。军方得知后企图抓捕他用于生化武器研究，杰克的妻子艾米丽却发现他的变异背后隐藏着更可怕的真相——病毒来自一个远古海洋文明，它们正计划通过改造人类来占领陆地。杰克必须在保护家人和阻止外星殖民之间做出抉择，最终他选择引爆海底基地，与外星母体同归于尽，用生命拯救了人类。